MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 56940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015387	CG	3	6	216054	216059	0 %	0 %	50 %	50 %	328949755
5502	NC_015387	CCCCTC	2	12	216065	216076	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	328949755
5503	NC_015387	GC	3	6	216085	216090	0 %	0 %	50 %	50 %	328949755
5504	NC_015387	GCC	2	6	216101	216106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949755
5505	NC_015387	CCT	2	6	216172	216177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949755
5506	NC_015387	TCA	2	6	216183	216188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949755
5507	NC_015387	GAG	2	6	216226	216231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949755
5508	NC_015387	CTCGGT	2	12	216261	216272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949756
5509	NC_015387	GCT	2	6	216273	216278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949756
5510	NC_015387	CGG	2	6	216284	216289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949756
5511	NC_015387	CTG	2	6	216349	216354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949756
5512	NC_015387	TCG	2	6	216395	216400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949756
5513	NC_015387	GCC	2	6	216405	216410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949756
5514	NC_015387	TCC	2	6	216449	216454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949756
5515	NC_015387	G	7	7	216456	216462	0 %	0 %	100 %	0 %	328949756
5516	NC_015387	CTC	2	6	216490	216495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949756
5517	NC_015387	ACG	2	6	216527	216532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949756
5518	NC_015387	GGCCC	2	10	216534	216543	0 %	0 %	40 %	60 %	328949756
5519	NC_015387	GGT	2	6	216558	216563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949756
5520	NC_015387	CGC	3	9	216576	216584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949756
5521	NC_015387	GCG	2	6	216585	216590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949756
5522	NC_015387	GCC	2	6	216598	216603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949756
5523	NC_015387	GC	3	6	216664	216669	0 %	0 %	50 %	50 %	328949756
5524	NC_015387	C	6	6	216698	216703	0 %	0 %	0 %	100 %	328949756
5525	NC_015387	TTC	2	6	216709	216714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949756
5526	NC_015387	CG	3	6	216715	216720	0 %	0 %	50 %	50 %	328949756
5527	NC_015387	CTC	2	6	216724	216729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949756
5528	NC_015387	GAC	2	6	216772	216777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949756
5529	NC_015387	CTC	2	6	216865	216870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949756
5530	NC_015387	CGG	2	6	216884	216889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949756
5531	NC_015387	GCC	2	6	216940	216945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949757
5532	NC_015387	GCCCC	2	10	217016	217025	0 %	0 %	20 %	80 %	328949757
5533	NC_015387	TCCC	2	8	217056	217063	0 %	25 %	0 %	75 %	328949757
5534	NC_015387	CG	3	6	217089	217094	0 %	0 %	50 %	50 %	328949757
5535	NC_015387	GCC	2	6	217113	217118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949757
5536	NC_015387	GCG	2	6	217129	217134	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949757
5537	NC_015387	CGG	2	6	217168	217173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949757
5538	NC_015387	CGG	2	6	217189	217194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949757
5539	NC_015387	CGC	2	6	217196	217201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949757
5540	NC_015387	GCG	2	6	217221	217226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949757
5541	NC_015387	CGG	2	6	217234	217239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949757
5542	NC_015387	CG	5	10	217259	217268	0 %	0 %	50 %	50 %	328949757
5543	NC_015387	TCC	3	9	217288	217296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949757
5544	NC_015387	GGGC	2	8	217298	217305	0 %	0 %	75 %	25 %	328949757
5545	NC_015387	TG	3	6	217337	217342	0 %	50 %	50 %	0 %	328949757
5546	NC_015387	CCTCGT	2	12	217364	217375	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	328949757
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5549	NC_015387	G	6	6	217435	217440	0 %	0 %	100 %	0 %	328949757
5550	NC_015387	CGG	2	6	217456	217461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949757
5551	NC_015387	GCGG	2	8	217463	217470	0 %	0 %	75 %	25 %	328949757
5552	NC_015387	CTGG	2	8	217476	217483	0 %	25 %	50 %	25 %	328949757
5553	NC_015387	CGG	2	6	217569	217574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949757
5554	NC_015387	TGA	2	6	217591	217596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949757
5555	NC_015387	GGCTCG	2	12	217599	217610	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	328949757
5556	NC_015387	GGA	2	6	217637	217642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949757
5557	NC_015387	GGT	2	6	217648	217653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949757
5558	NC_015387	CGCGG	2	10	217655	217664	0 %	0 %	60 %	40 %	328949757
5559	NC_015387	GC	3	6	217694	217699	0 %	0 %	50 %	50 %	328949757
5560	NC_015387	CG	3	6	217734	217739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5561	NC_015387	GGCGT	2	10	217757	217766	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5562	NC_015387	G	6	6	217799	217804	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_015387	CCTTCC	2	12	217875	217886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5564	NC_015387	TAT	2	6	217903	217908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	328949758
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5571	NC_015387	GTG	2	6	218363	218368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949758
5572	NC_015387	CGC	2	6	218419	218424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949758
5573	NC_015387	GGA	2	6	218431	218436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949758
5574	NC_015387	GGCC	2	8	218455	218462	0 %	0 %	50 %	50 %	328949758
5575	NC_015387	CGG	2	6	218470	218475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949758
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5593	NC_015387	CG	3	6	219394	219399	0 %	0 %	50 %	50 %	328949759
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5602	NC_015387	CG	3	6	219722	219727	0 %	0 %	50 %	50 %	328949759
5603	NC_015387	CG	3	6	219736	219741	0 %	0 %	50 %	50 %	328949759
5604	NC_015387	TTC	2	6	219791	219796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	328949759
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5621	NC_015387	GGC	2	6	220242	220247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949759
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5623	NC_015387	GGT	2	6	220318	220323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	328949759
5624	NC_015387	GTC	2	6	220376	220381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949759
5625	NC_015387	GCCCTT	2	12	220430	220441	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	328949759
5626	NC_015387	TGC	2	6	220446	220451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949759
5627	NC_015387	GCTCT	2	10	220454	220463	0 %	40 %	20 %	40 %	328949759
5628	NC_015387	TCC	2	6	220476	220481	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949759
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5657	NC_015387	GGC	2	6	221545	221550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949761
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5690	NC_015387	GAT	2	6	222614	222619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5697	NC_015387	GGTA	2	8	222899	222906	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5698	NC_015387	GCG	2	6	222948	222953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949764
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5704	NC_015387	GC	3	6	223078	223083	0 %	0 %	50 %	50 %	328949764
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5716	NC_015387	CG	3	6	223666	223671	0 %	0 %	50 %	50 %	328949764
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5720	NC_015387	CG	3	6	223780	223785	0 %	0 %	50 %	50 %	328949764
5721	NC_015387	TAC	2	6	223820	223825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949764
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5723	NC_015387	TAC	2	6	223901	223906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	328949764
5724	NC_015387	CCG	2	6	224032	224037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5725	NC_015387	CG	3	6	224041	224046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5726	NC_015387	TCG	3	9	224053	224061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949765
5727	NC_015387	CTG	2	6	224062	224067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949765
5728	NC_015387	TCC	3	9	224068	224076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949765
5729	NC_015387	TCG	2	6	224077	224082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949765
5730	NC_015387	GTC	2	6	224088	224093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949765
5731	NC_015387	GTC	2	6	224112	224117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949765
5732	NC_015387	CGC	2	6	224132	224137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949765
5733	NC_015387	GTC	2	6	224163	224168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	328949765
5734	NC_015387	CTC	2	6	224169	224174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949765
5735	NC_015387	TCC	2	6	224188	224193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949765
5736	NC_015387	CCCGG	2	10	224236	224245	0 %	0 %	40 %	60 %	328949765
5737	NC_015387	CTC	3	9	224259	224267	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949765
5738	NC_015387	CTC	3	9	224292	224300	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949765
5739	NC_015387	TCC	2	6	224305	224310	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	328949765
5740	NC_015387	TGA	2	6	224390	224395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949765
5741	NC_015387	TGCGCG	2	12	224410	224421	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	328949765
5742	NC_015387	CGC	2	6	224424	224429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949765
5743	NC_015387	GAG	2	6	224442	224447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	328949765
5744	NC_015387	GTA	2	6	224493	224498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	328949765
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5991	NC_015387	AGC	2	6	234314	234319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949775
5992	NC_015387	CGC	2	6	234351	234356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949775
5993	NC_015387	GCGTG	2	10	234432	234441	0 %	20 %	60 %	20 %	328949775
5994	NC_015387	GC	3	6	234459	234464	0 %	0 %	50 %	50 %	328949775
5995	NC_015387	GGC	2	6	234532	234537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949775
5996	NC_015387	CGA	2	6	234561	234566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	328949775
5997	NC_015387	CGC	2	6	234579	234584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	328949775
5998	NC_015387	CCCT	2	8	234587	234594	0 %	25 %	0 %	75 %	328949776
5999	NC_015387	GT	3	6	234618	234623	0 %	50 %	50 %	0 %	328949776
6000	NC_015387	CGG	2	6	234722	234727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	328949776

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